アトピー性皮膚炎患者の皮膚は、明確な病変部位外にも、乾燥した特異な性状を示すことがある。乾燥部位からは皮脂やセラミドが失われ、外部からアレルゲンの侵入を容易にしていると考えられている。また痒みの一因ともなり皮膚の回復が妨げられている。炎症に対する治療だけでなく、このような皮膚の性状に対処すること（スキンケア）もまた、治療の根幹である。スキンケアを丹念に行うことにより劇的に改善することもあるため、ステロイド外用剤などだけでなく、保湿剤を使用することは重要である。実際の処方では、ワセリン、プラスチベース®等の油性のものや、適度に水分を含んだクリーム状の保湿剤がよく使われる。
気候の乾燥したヨーロッパ等ではアトピーと真菌の患者はとても少ない。
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風邪薬などの成分である消炎・鎮痛薬（イブプロフェンなど）の外用剤（アンダームクリーム、スタデルムクリームなど）を使用することがある。いずれも穏やかでステロイドほど劇的な効果は得にくいとも言われる。接触性皮膚炎を高率に起こすことがある。
抗ヒスタミン外用薬（レスタミン軟膏など）を使用することがある。痒みは低下するが、炎症を抑える効果は低いとされている。
皮膚科の専門医が漢方薬を処方する場合もある。そのような場で処方される場合、顆粒状に加工されたエキス剤であることが多い。健康保険が適用される。
痒みが強い場合、必要に応じて抗アレルギー薬・抗ヒスタミン薬を使用する。